More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1083 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  48.82 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  47.97 
 
 		 277 aa  114  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 169 aa  113  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  47.11 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  46.28 
 
 		 160 aa  105  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  45.9 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  42.15 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  39.37 
 
 		 155 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  38.2 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  31.73 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  46.94 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  45.76 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.19 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  44.9 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  44.9 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  27.12 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>