100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4485 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  88.32 
 
 		 137 aa  254  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  84.67 
 
 		 137 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  76.16 
 
 		 152 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  72.33 
 
 		 158 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  72.33 
 
 		 158 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  72.44 
 
 		 160 aa  227  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 137 aa  227  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 137 aa  224  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  79.56 
 
 		 151 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  80.15 
 
 		 137 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  80.15 
 
 		 137 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 137 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  78.26 
 
 		 141 aa  223  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  78.26 
 
 		 141 aa  223  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  78.26 
 
 		 141 aa  223  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  80.15 
 
 		 137 aa  223  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  79.41 
 
 		 137 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  61.07 
 
 		 139 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  63.41 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  67.97 
 
 		 144 aa  154  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  68.14 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  59.06 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  50.79 
 
 		 277 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  43.31 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 148 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 196 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  37.35 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  37.23 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 146 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 147 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 153 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.32 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 183 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.48 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  30.77 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>