137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2241 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  74.32 
 
 		 151 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  74.32 
 
 		 151 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  50.76 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  50.76 
 
 		 160 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 172 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 183 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 191 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  39.82 
 
 		 191 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 187 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 185 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 186 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 226 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 179 aa  89.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 169 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 174 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 237 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 185 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  38.6 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 184 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  36.61 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.59 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 347 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  24.3 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.04 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 347 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 349 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.43 
 
 		 349 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  23.39 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 325 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>