121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2698 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  97.24 
 
 		 145 aa  287  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  77.04 
 
 		 139 aa  219  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  62.5 
 
 		 160 aa  173  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  61.03 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  64.52 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  58.09 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 137 aa  163  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 137 aa  163  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 169 aa  141  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  57.6 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  58.2 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  49.14 
 
 		 277 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  42.24 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  25.23 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.68 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  36.71 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  31.33 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  23.36 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  32.5 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 141 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.05 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  40.54 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  32.54 
 
 		 945 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>