193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1303 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
137 aa  279  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  94.89 
 
 
152 aa  267  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  94.89 
 
 
137 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  97.06 
 
 
158 aa  266  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  97.06 
 
 
158 aa  266  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  97.06 
 
 
137 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  95.62 
 
 
137 aa  265  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  82.48 
 
 
137 aa  234  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  82.48 
 
 
137 aa  234  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  82.48 
 
 
151 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  81.75 
 
 
141 aa  233  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  81.75 
 
 
141 aa  233  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  81.75 
 
 
141 aa  233  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  81.75 
 
 
160 aa  233  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  81.75 
 
 
137 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  81.62 
 
 
137 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  80.15 
 
 
137 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  80.15 
 
 
160 aa  223  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  66.41 
 
 
151 aa  170  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 
169 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  61.07 
 
 
139 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  60.48 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  61.11 
 
 
138 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  61.29 
 
 
135 aa  150  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  59.5 
 
 
141 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
139 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  52.89 
 
 
139 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  50.79 
 
 
277 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  53.39 
 
 
156 aa  122  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  47.11 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 
162 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
155 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  39.5 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
204 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  40.96 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
152 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
159 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
171 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  37.84 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  36.94 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  34.74 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 
156 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
155 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  32 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>