202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1402 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
137 aa  275  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  275  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
137 aa  275  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  99.27 
 
 
141 aa  274  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  99.27 
 
 
141 aa  274  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  99.27 
 
 
141 aa  274  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  99.27 
 
 
137 aa  274  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  96.35 
 
 
160 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  84.67 
 
 
137 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  84.56 
 
 
158 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  84.56 
 
 
158 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  84.56 
 
 
137 aa  238  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 
152 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 
137 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  82.48 
 
 
137 aa  234  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  81.62 
 
 
137 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  83.82 
 
 
137 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  80.15 
 
 
160 aa  224  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 
151 aa  174  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  63.7 
 
 
139 aa  173  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  65.62 
 
 
169 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  61.76 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  61.03 
 
 
145 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  64.8 
 
 
141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  61.83 
 
 
135 aa  156  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  64.71 
 
 
138 aa  155  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  67.94 
 
 
144 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  57.81 
 
 
141 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
139 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  51.59 
 
 
277 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 
156 aa  122  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
162 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  47.11 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
141 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  40.34 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  40 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
149 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
204 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
180 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
180 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
180 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  40.96 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  41.49 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 
162 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
153 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
180 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
155 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.34 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.28 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  36.84 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
167 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>