87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5811 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  69.86 
 
 		 148 aa  193  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  76.3 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  50.37 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  38.89 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  38.21 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  38.66 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  38.21 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  34.02 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  37.66 
 
 		 143 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 175 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 154 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  28.74 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  34.33 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>