More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9024 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  55.13 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  47.15 
 
 		 137 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  45.6 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  39.84 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.31 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  33.64 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  28.99 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  29.85 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  36.19 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>