More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1756 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  46.21 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  46.21 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 138 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  41.04 
 
 		 138 aa  116  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  39.39 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  46.25 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  36.63 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 233 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  38.04 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 177 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>