More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0218 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  99.3 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  49.61 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  45.65 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  35.19 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.1 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 183 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 167 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 170 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.14 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  31.03 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  28.7 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.86 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.86 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  40.96 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  26.96 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  28.68 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 189 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  26.02 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>