More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1292 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.96 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
183 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
151 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.65 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  33.66 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  31.96 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  31.63 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  27 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  27.34 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
150 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
155 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.99 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  29.59 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
165 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.87 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>