More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0201 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
149 aa  294  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  55.8 
 
 
147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
151 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  26.19 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  36.9 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
267 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  25.93 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 
173 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  33.01 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.05 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
157 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
142 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
148 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 
154 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
150 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
177 aa  51.6  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
150 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
160 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 
160 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  22.33 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 
160 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  25.27 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  32.53 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  25.89 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  24.27 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  25 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  31.07 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>