More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1519 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
144 aa  278  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0188  transcriptional regulator, MarR family  55.73 
 
 
184 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  42.37 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  40.18 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
177 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  41.82 
 
 
324 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.6 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
165 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  34.95 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  36.81 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  50.82 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
177 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
167 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  33.33 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  45.21 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  40.52 
 
 
163 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  34.06 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
170 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
205 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 
144 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 
163 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  36.63 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 
173 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  26.32 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  37.3 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
411 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>