More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5361 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  49.59 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  38.85 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  39.01 
 
 		 324 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  36.92 
 
 		 153 aa  85.1  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  34.88 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  31.21 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  35.63 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.5 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  34.88 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  27.5 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  34.04 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>