More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1849 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
145 aa  284  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  49.62 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  54.17 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 
168 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  36.92 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  33.09 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  41.24 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.46 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.94 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
204 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
173 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  33.04 
 
 
195 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
151 aa  60.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  41.33 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
171 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
170 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 
183 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
156 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
159 aa  60.1  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  40.79 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  32.76 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  37.63 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
161 aa  58.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
171 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  34.78 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
170 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
166 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
161 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
161 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
161 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  34.26 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>