More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4151 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
163 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  23.39 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  23.39 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.8 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  23.39 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  23.39 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  30.82 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
168 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.83 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  30.7 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  28.83 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0817  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.3 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.3 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.01 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  28.91 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  27.97 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>