More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1943 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 157 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  83.54 
 
 		 158 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 157 aa  268  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  83.54 
 
 		 158 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  83.54 
 
 		 158 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  83.54 
 
 		 158 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  83.54 
 
 		 158 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  82.28 
 
 		 160 aa  267  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  81.01 
 
 		 165 aa  261  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  81.01 
 
 		 165 aa  261  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  80.38 
 
 		 158 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  80.25 
 
 		 160 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  78.48 
 
 		 158 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  76.73 
 
 		 161 aa  246  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 158 aa  242  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  57.14 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  56.49 
 
 		 167 aa  180  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  54.55 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 148 aa  164  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  45.14 
 
 		 191 aa  138  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  45.89 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  45 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  40 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  36.18 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  36.3 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  33.33 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  37 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  42.86 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  36.59 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  32.41 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>