More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4007 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  300  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  55.1 
 
 		 160 aa  170  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 165 aa  170  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 165 aa  170  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 158 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  55.78 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  55.78 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  49.66 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  47.97 
 
 		 161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  47.62 
 
 		 158 aa  140  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 181 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  48.3 
 
 		 167 aa  136  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  42.07 
 
 		 191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  41.04 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  43.36 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  39.29 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 167 aa  104  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 187 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  37.12 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 177 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  31.69 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 180 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 178 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  33.61 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  36 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  24.09 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  25.52 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  35.14 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 157 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  26.67 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>