More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4823 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  323  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  81.65 
 
 
159 aa  260  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  70.81 
 
 
160 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  70.81 
 
 
160 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  70.81 
 
 
160 aa  224  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  66.01 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  62.09 
 
 
159 aa  179  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  57.33 
 
 
153 aa  164  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  56.85 
 
 
151 aa  164  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  57.05 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  54.79 
 
 
170 aa  160  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  56.85 
 
 
157 aa  157  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  56.16 
 
 
148 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
144 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.65 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  48.03 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  44.52 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 
155 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  48.23 
 
 
146 aa  131  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
149 aa  123  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  47.33 
 
 
164 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  40.25 
 
 
163 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  45.89 
 
 
146 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  45.62 
 
 
161 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
143 aa  121  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
144 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  47.89 
 
 
153 aa  120  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.67 
 
 
152 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  43.88 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
150 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.19 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  40.61 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 
146 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 
147 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  43.05 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  44.14 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  50.41 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  40.69 
 
 
146 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  40.69 
 
 
146 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
146 aa  114  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
163 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
151 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 
169 aa  114  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
163 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  41.96 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
156 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
163 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  47.93 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  41.78 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  40.25 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
267 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
168 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 
147 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
165 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
156 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  46.92 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
150 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 
150 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
150 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
150 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  43.62 
 
 
150 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
150 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  44.36 
 
 
165 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
178 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
145 aa  110  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
165 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
165 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
152 aa  110  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  42.11 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>