More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1151 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  52.03 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  52.03 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  46.98 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  46 
 
 		 191 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  50.74 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  45.89 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  46 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  45.14 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  45.93 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  39.01 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  38.06 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  33.59 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  23.24 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  24.82 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  21.58 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.19 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>