More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2248 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  46.85 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  45.65 
 
 		 154 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  46.48 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 165 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  48.41 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  51.2 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  46.85 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  47.15 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  46.85 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  49.12 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  43.66 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  46.77 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  46.62 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  43.8 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  48.25 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  43.28 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 155 aa  113  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  46.43 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  46.72 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  57.58 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  46.72 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  46.56 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  45.52 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  44.53 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  46.55 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  47.69 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  44.17 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.92 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  51.35 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  49.55 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  45.74 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  45.74 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  40.88 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 267 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>