More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2736 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  316  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 157 aa  264  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  82.8 
 
 		 157 aa  263  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  78.48 
 
 		 160 aa  253  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  77.85 
 
 		 158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  78.48 
 
 		 161 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  77.22 
 
 		 158 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  77.22 
 
 		 158 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  77.22 
 
 		 158 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  77.22 
 
 		 158 aa  250  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  77.22 
 
 		 165 aa  250  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  77.22 
 
 		 165 aa  250  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  77.22 
 
 		 158 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  74.52 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  73.58 
 
 		 161 aa  235  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  75.48 
 
 		 158 aa  234  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  54.43 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  54.55 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 174 aa  177  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  53.9 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 159 aa  166  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  46.21 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  48.95 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  45.71 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  42.22 
 
 		 135 aa  121  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  36.81 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 177 aa  94.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  34.93 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  32.59 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  25.85 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  34.68 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  36 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  26.32 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  30.19 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  28.57 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  35.48 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>