More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  100 
 
 
153 aa  295  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  72.73 
 
 
171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  61.11 
 
 
157 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  61.11 
 
 
157 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
173 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
174 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
181 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
165 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
165 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  34.07 
 
 
160 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  32.82 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  35.16 
 
 
191 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  30.3 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  31.82 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  32.58 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
159 aa  84  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  31.85 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  31.88 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  35.88 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
182 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
159 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
170 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
190 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31.82 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
140 aa  57.4  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  49.33 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  35.58 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  34.95 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.07 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  40.57 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>