More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0178 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  59.18 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  44.16 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1154  MarR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  34.72 
 
 		 163 aa  97.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  33.1 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  30.15 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  31.43 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  30.71 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  30.88 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  28.77 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  28.76 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 148 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  30.15 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  26.71 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  28.38 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  29.93 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  32.06 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  31.3 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  35.65 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 325 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  37.36 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  37.18 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0791  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.123564  normal  0.0209412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.06 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>