More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2362 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
173 aa  347  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  60.26 
 
 
168 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  51.68 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
153 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 
147 aa  87.8  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 
191 aa  87  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
172 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
181 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  32.84 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  34.01 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  31.29 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  29.55 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  28.03 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.69 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  26.06 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  28.68 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  26.77 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  34.55 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.78 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.78 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  25.85 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  34.29 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  34.95 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
138 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  33.64 
 
 
146 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>