More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1835 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
146 aa  286  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  71.92 
 
 
146 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
204 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
190 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  42.67 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
143 aa  60.5  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  44.93 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
208 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  38.82 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 
158 aa  57.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.84 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1670  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000203174  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  30.1 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  28.85 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
181 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  39.56 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 
191 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
189 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  26.27 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  26.27 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.97 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  37.66 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  37.66 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
152 aa  53.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
170 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
219 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
200 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>