More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1772 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  320  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  85.35 
 
 		 157 aa  278  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 158 aa  273  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 158 aa  273  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  84.71 
 
 		 157 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  84.18 
 
 		 158 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  84.18 
 
 		 158 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  84.18 
 
 		 158 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  82.91 
 
 		 165 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  82.91 
 
 		 165 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  83.23 
 
 		 161 aa  267  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  82.28 
 
 		 161 aa  267  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  82.28 
 
 		 158 aa  266  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  83.44 
 
 		 160 aa  264  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  78.48 
 
 		 158 aa  253  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  79.35 
 
 		 158 aa  252  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  56.49 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  56.96 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  56.49 
 
 		 167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 174 aa  180  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  46.43 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  42.76 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  48.25 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  42.22 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 177 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  38.13 
 
 		 162 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  41.53 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  41.53 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  34.07 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  25.71 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  36.27 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  36.84 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>