More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1669 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  99.36 
 
 		 157 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  61.87 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 171 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  41.1 
 
 		 191 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  41.35 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 181 aa  100  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  36.03 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  38.52 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  35.97 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  37.78 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  35.97 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  36.5 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  35.38 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 182 aa  90.5  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 167 aa  87  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  36.8 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  35.29 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  27.05 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.29 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  38.82 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>