More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5537 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 161 aa  322  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  35.46 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  34.29 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  36.03 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  32.88 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  56.82 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  33.91 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  28.36 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 219 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 200 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  39.13 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 233 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  36.79 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30.28 
 
 		 283 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 172 aa  47.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>