More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6536 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 149 aa  290  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  43.06 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 157 aa  97.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  34.29 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  43.69 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  38.75 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  32.41 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.58 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  36.25 
 
 		 174 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  31.4 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 159 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  49.18 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  24.56 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  35.63 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.23 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  42 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.18 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  42 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.18 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  42 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  42 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  39.56 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>