293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23820 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  300  5.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  35.46 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  33.05 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  30 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  28.93 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  34 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  27.64 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  36.84 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 203 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  25.88 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  30.84 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.44 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.44 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  22 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.44 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.44 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>