More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  39.86 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  36.84 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  38.81 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  34.09 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  29.27 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  53.06 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  43.01 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.93 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0053  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  36.96 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  28 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  37.74 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  26.85 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  52 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1297  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  37.5 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  50.98 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.17 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 205 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>