234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1596 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  289  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  43.93 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  38.24 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  40.18 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  45.21 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  30.09 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  29.2 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  26.96 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  29.41 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  33.87 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  36.19 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  42.42 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  24.04 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  35.06 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  46.55 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  40.66 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  32.77 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>