97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4639 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  80 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  83.13 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  73.37 
 
 		 161 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  76.82 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  70.7 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  68.32 
 
 		 168 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  62.8 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 149 aa  117  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  41.75 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  48.78 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  37.8 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 128 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  32.35 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  50.91 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  30.97 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  41.94 
 
 		 292 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  36.59 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  35.37 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  44.9 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  26.36 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 127 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 157 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 163 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  35.29 
 
 		 261 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 157 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  47.17 
 
 		 165 aa  42  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  37.8 
 
 		 154 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 149 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 142 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 142 aa  42  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  42  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 167 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 142 aa  42  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  51.16 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 135 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 153 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 146 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  28.26 
 
 		 137 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>