More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2302 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 127 aa  244  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  48.25 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  44.07 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  41.24 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40.78 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  41.33 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  40.51 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  37 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  32.63 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  28.85 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  41.03 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  28.85 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  33.03 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  37.72 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>