More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6078 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 143 aa  271  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  61.48 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  38.51 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  42.5 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  43.3 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  41.38 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  39.06 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.82 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  36.17 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  40.4 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  38.14 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.23 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  54.72 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>