More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2733 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  285  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  72.34 
 
 		 146 aa  209  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  75.19 
 
 		 155 aa  189  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  75.19 
 
 		 155 aa  189  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  74.63 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  68.38 
 
 		 163 aa  174  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  39.09 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  37.06 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 208 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 148 aa  66.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  43.96 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  31.88 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  35.11 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  32.09 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  33.09 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  39.53 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  33.93 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  38.32 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>