272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0763 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.69 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  45.59 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5295  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  32.67 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  24.29 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  24.29 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 184 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  46.03 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  32.71 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  31.46 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.77 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.83 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  34.83 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.83 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.83 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  34.83 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  34.83 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.83 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 208 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 207 aa  44.3  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>