More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4344 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  284  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  75 
 
 		 139 aa  210  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  56.74 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  56.34 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  44.21 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 164 aa  72  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  45.05 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  36.89 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  43.3 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  43.56 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  48.53 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  46.58 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  39.77 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  49.09 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  49.12 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  28.57 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  42.39 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  42.5 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  31.71 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>