116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2118 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  63.5 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  65.41 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  44.36 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 175 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  31.4 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  39.34 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.07 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  32.58 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  35.29 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  24.11 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  29.58 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  29.35 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  25.27 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2268  regulatory protein, MarR  28.91 
 
 		 159 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 159 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  38.03 
 
 		 213 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 334 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 213 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 		 157 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 170 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  25.32 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  37.74 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 168 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  27.71 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>