More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1494 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 		 151 aa  183  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30.84 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  37.93 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3525  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  30.28 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  32.58 
 
 		 324 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  27.27 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  32.26 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  29.29 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  25.98 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06420  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  38.16 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  28.1 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 411 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>