More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1178 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  70.25 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 159 aa  190  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  26.28 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  22.32 
 
 		 203 aa  50.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  36.67 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  37.1 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30.69 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  28.85 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.41 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28.41 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 334 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  29.81 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>