More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5020 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  74.26 
 
 
141 aa  181  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
139 aa  173  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  68.38 
 
 
139 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  68.38 
 
 
139 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  60.43 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  60.43 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  60.43 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  60.43 
 
 
159 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  60.43 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  60.43 
 
 
159 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  59.71 
 
 
159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  52.99 
 
 
144 aa  133  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5859  MarR family transcriptional regulator  68.29 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346402  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  38.81 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31.3 
 
 
214 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5857  MarR family transcriptional regulator  48.33 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0150711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40.26 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
307 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 
142 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
168 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
205 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  34.91 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.73 
 
 
287 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  30.63 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  27.87 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
195 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 
187 aa  47.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  32.67 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  34.82 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  29.89 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  46.88 
 
 
127 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
139 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
172 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
171 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
149 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
148 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 
150 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
159 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  34.51 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
165 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  44.07 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>