228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2446 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  100 
 
 		 149 aa  290  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5859  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  47.5 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  33.75 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.12 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  34.82 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  36.75 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 340 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  32.32 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  43.4 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  38.03 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 326 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2094  regulatory protein MarR  36.67 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  35.9 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  46.3 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 320 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  32 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.14 
 
 		 326 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 347 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>