201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0115 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  100 
 
 
169 aa  328  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
185 aa  85.1  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  40.31 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  41.13 
 
 
185 aa  82  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  37.42 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  37.14 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 
181 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 
203 aa  54.7  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
151 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
138 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  27.07 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
160 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 
153 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
160 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
160 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
160 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
160 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
160 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
160 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
189 aa  50.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  41.49 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  35.16 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  28.81 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 
169 aa  48.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  30 
 
 
139 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  40.74 
 
 
174 aa  47.4  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  36.75 
 
 
149 aa  47.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 
144 aa  47.4  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 
163 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  35.48 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
197 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.22 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.22 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.22 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.22 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.22 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.22 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
146 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
160 aa  44.3  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 
166 aa  44.3  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 
175 aa  44.3  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
146 aa  44.3  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  37.25 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0297  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  37.25 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  38.95 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  38.24 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  29 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  24.37 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  52.63 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>