247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2084 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
163 aa  340  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  27.91 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
136 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
146 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  30.84 
 
 
156 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
175 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  37.14 
 
 
139 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  27.94 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
180 aa  47.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  31.17 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
157 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
143 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  33.33 
 
 
168 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
163 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
149 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3369  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 
148 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  27.17 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.72 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  25.9 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  31.82 
 
 
292 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  27.17 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.83 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  29.81 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2360  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00354058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  30.59 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
137 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
201 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.62 
 
 
312 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  27.52 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.75 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
187 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0079  hypothetical protein  29.82 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.75 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 
168 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  43.14 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
173 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  21.47 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
156 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>