More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3479 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 165 aa  336  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 165 aa  336  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  89.58 
 
 		 158 aa  273  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 148 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 148 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 148 aa  187  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  62.59 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 157 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 144 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  56.55 
 
 		 169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  51.33 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  32.82 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  32.12 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  28.97 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  25.36 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>