More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3895 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  100 
 
 
167 aa  338  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  81.76 
 
 
185 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  81.76 
 
 
185 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  81.13 
 
 
167 aa  263  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  80.5 
 
 
165 aa  262  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  79.25 
 
 
165 aa  261  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  78.62 
 
 
180 aa  256  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  70.62 
 
 
166 aa  214  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  58.54 
 
 
168 aa  187  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  57.32 
 
 
207 aa  184  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 
170 aa  184  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  49.7 
 
 
185 aa  164  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  50.61 
 
 
168 aa  157  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  47.27 
 
 
179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  46.63 
 
 
173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  46.01 
 
 
177 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  44.17 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  44.91 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  45.62 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  45.68 
 
 
166 aa  137  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  44.79 
 
 
162 aa  133  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  43.56 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  46.91 
 
 
174 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  34.21 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 
143 aa  54.7  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
147 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 
140 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  36.94 
 
 
174 aa  50.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  42.86 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  41.33 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3891  hypothetical protein  22.9 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1206  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.0194653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
180 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1179  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
141 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317868  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
152 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
141 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
138 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  55.81 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
164 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>