151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1179 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1179  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1206  MarR family transcriptional regulator  99.29 
 
 
141 aa  276  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.0194653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  42.52 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  36.51 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
170 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  33.6 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
185 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
185 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
167 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  46.15 
 
 
166 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 
179 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  48.44 
 
 
185 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
194 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
181 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
194 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
194 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 
172 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
167 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  36.59 
 
 
177 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  30.28 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  45.9 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
179 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  40 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  34.78 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  34.41 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  31.17 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
167 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  29.06 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2146  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 
211 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  0.322548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
157 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  47.17 
 
 
325 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  31.62 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  35 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  59.38 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  38.38 
 
 
164 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
168 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
139 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 
150 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
168 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
139 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  28.87 
 
 
146 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>