More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1105 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  290  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7125  transcriptional regulator, MarR family  53.38 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 161 aa  98.6  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36.78 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  35.82 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 171 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  29.69 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  29.66 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  34.33 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  31.3 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.33 
 
 		 172 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  34.34 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 182 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 151 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 164 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.08 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  37.93 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  28.93 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  33.01 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 139 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  33.01 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  36.14 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>